DER.PY ist eine Sammlung von Python-Skripten die ich für die Auswertung von Messwerten, im Rahmen meiner BSc-Arbeit geschrieben habe - sauber strukturiert, gut dokumentiert, keineswegs Spaghetti-Code und auch nicht mit heißen Nadeln gestrickt.

Es automatisiert das Erstellen von wissenschaftlichen Diagrammen aus:

• OD600/OD660-Messungen
• HPLC-Daten
• C-Bilanzen

Die Diagramme beinhalten automatisch Fehlerbalken, standardisierte Formatierungen und ermöglichen den direkten Vergleich verschiedener Stämme, sodass Unterschiede zwischen Wildtyp und modifizierten-Stämmen oder anderen Varianten leicht sichtbar werden.

Alle relevanten Parameter (Farben, Marker, Linienarten, Pfade, Diagrammgröße) werden zentral in der config.py verwaltet, während der.py die einzelnen Auswertungsscripts nacheinander aufruft.

• Zentralisierte Konfiguration für Farben, Marker, Linienarten und Diagrammgröße

• Automatisches Erstellen von Output-Ordnern

• Erstellung wissenschaftlicher Diagramme inkl. Fehlerbalken

• Vergleich von verschiedenen Stämmen direkt in den Diagrammen

• Modularer Aufbau: einfache Erweiterung auf neue Analysen

• Python 3.x
• Eine virtuelle Umgebung (empfohlen)

# Erstelle eine virtuelle Umgebung python3 -m venv derpy # Aktiviere die virtuelle Umgebung source derpy/bin/activate # Installiere die Abhängigkeiten pip install -r requirements.txt

• openpyxl
• matplotlib
• pandas
• numpy
• scipy

derpy/ │ ├── Rohdaten/ │ ├── Auswertung_CBilanz.xlsx │ ├── Auswertung_HPLC.xlsx │ └── Auswertung_OD.xlsx │ ├── config.py ├── requirements.txt ├── der.py ├── Diagramme_OD.py ├── Diagramme_HPLC.py ├── Diagramme_CBilanz.py ├── gesamt_cBilanz.py ├── stammvergleich_daco1.py └── stammvergleich_tu20.py 

Platziere die xlsx-Dateien mit den Rohdaten im Verzeichnis Rohdaten. Achte darauf, dass die Dateien denselben Aufbau wie die Beispiel-Dateien (Auswertung_CBilanz.xlsx, Auswertung_HPLC.xlsx, Auswertung_OD.xlsx) haben, am einfachsten passt man die eigenen Daten direkt an diese Dateien an. Passe den Pfad und die Parameter in der config.py an, um deine spezifischen Anforderungen zu erfüllen.

Führe nun in der virtuellen Umgebung der.py aus. Die benötigten Verzeichnisse für die Diagramme werden automatisch erstellt.

python der.py

Der Name DER.PY leitet sich humorvoll von „Derpiness“ (dt. Dummheit / Tollpatschigkeit) ab, genau wie Derpy Hooves aus My Little Pony.

MIT – nimm, kopiere, teile, verbessere!

Forks & Pull Requests sind absolut willkommen 💜

Anpassungen an das eigene Projekt, z. B. zur Erweiterung um neue Funktionen, sind ausdrücklich erwünscht.